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以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设人类医学数据关联分析精品班。
为了确保教学质量,授课团队由具有9年以上统计学、遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔,曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题,具有丰富的论文写作、发表经验,小班人数限15-20人,额满为止,预报从速!
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:第三期2015年8月13-15日
日期 |
授课题目 |
授课内容 |
第一天 |
概率论和统计学理论基础 |
1、经典概率论及其统计 2、贝叶斯概率及其统计 |
R语言统计分析 |
3、R语言基础 4、使用R语言进行基础统计学分析 |
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第二天 |
连锁分析和关联分析理论基础 |
5、连锁分析的原理及常用软件 6、候选基因关联分析的原理及常用软件 7、全基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件:基于芯片的GWAS,基于NGS的GWAS |
常用连锁、关联软件实习 |
8、MERLIN 9、Plink 10、Haploview等 |
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第三天 |
基于NGS的GWAS实用策略 |
11、转录组/外显子组测序原理 12、低覆盖度测序+基因型填充原理 13、Linux常用命令 |
基于NGS的GWAS上机 |
14、转录组/外显子组/基因组重测序数据分析 15、SNP分型及基因型获得 16、缺失基因型填充 17、NGS-GWAS 18、IGV可视化 19、ANNOVAR功能注释 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导
【报名费用】 注册费:4000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
4+1团报,可免费赠送一个名额
² 培训座位按收到报名表先后顺序安排,额满为止
【联系咨询】
张利英 010-59341771,18618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767
员丽丽 010-59341773,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
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