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WB,IH,IF,ICC实验外包服务
【嘉美生物】即日起推出WB, IH, ICC, IF实验服务优惠活动,细则如下:
1、嘉美生物提供原装进口抗体。
我实验室进行实验服务有若干年的历史,因此我们实验室存有大批的国外原装抗体;意味着实验者不必要花更多的钱去购买国外昂贵(一般都会需要2000元以上)的一抗。
2、嘉美生物免费提供二抗以及所有的与实验相关的后续试剂。
3、嘉美生物免费提供WB标本所需要的蛋白保护液。
该蛋白保护液可以保护样品在4度下保存半个月而不至于蛋白有损失。
4、实验委托者之需要提供样品,即可完成整个实验。
WB实验服务案例
注:SDS-PAGE凝胶浓度为12%;
阳性条带以Gel pro4.0 版凝胶光密度分析软件进行分析,测其IOD(integrated optical density)累积光密度参考值。
Fig 1:
WB操作规程
一.设备和试剂
1.设备
① 电泳电源
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell,Mini Teans-Blot Module,and PowerPac Basic Power Supply (BIO-RAD,Catalog#165-3323)
② 电泳仪及附件
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell (BIO-RAD,Catalog#165-3301)
③ 电转仪及附件
Mini Teans-Blot Elecreophoresis Transfer Cell (BIO-RAD,Catalog#170- 3930)
④ NC膜
PIERCE,Catalog#88018
⑤ 滤纸
Whatman,3MM CHR
2.试剂
① 凝胶试剂(实验室常备)
②Total protein Extraction Kit ,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200501
Renewable Buffer膜再生液,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200512
天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK•德国,Cat. No: 444810
天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK•德国,Cat. No:71183-3
Bradford蛋白浓度测定试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:BRAKIT
细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1001
细胞膜蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1003
③ 常用溶液及缓冲液
A.5%积层胶所用溶液
按总体积2.5ml:
ddH2O:1.7ml
30%丙烯酰胺溶液:0.42ml
1.0mol/L Tris (PH=6.8):0.315ml
10%SDS:25ul
10%过硫酸铵:25ul
TEMED:3ul
B.分离胶溶液配方参考表
3g Tris-base、14.4g 甘氨酸、1g SDS,加蒸馏水至IL,pH应该在8.3左右。也可以制成10×的储存液,在室温下长期保存。
D.电泳转移缓冲液,1L
3g Tris-base、14.4g 甘氨酸、甲醇200ml, 加蒸馏水至1L, 也可以制成10×的储存液,在湿温下长期保存。
E.5×样品缓冲液,10ml
0.6ml 1mol/L的Tris-HCl(Ph6.8)、5ml 50%的甘油、2ml 10%的SDS、0.5ml 2-巯基乙醇、1ml 1%溴酚蓝,0.9ml的蒸馏水,可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。
④ 二抗稀释液
用1%BSA-PBS(含0.05%TWEEN20)稀释。
常用Secondary Antibody :
Rabbit Anti Goat IgG/HRP,嘉美生物, SEH0103,(1:10,000~40,000)
Goat Anti Rabbit IgG/HRP (SCBT, Catalog# sc-2030,1:10,000~40,000)
Goat Anti Mouse IgG+A+M(H+L)/HRP, ZYMED, #62-64201(1:40,000~100,000)
Goat anti-rat IgG-HRP,SANTA, sc-2032(1:5 000~1:10 000)
二.蛋白提取(根据样品及检测要求选取以下适当提取方法)
A-1.组织裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).用剪刀剪取约0.5mg组织,置于组织匀浆器中,加入1ml 总蛋白提取液,匀浆5min~20min直到组织充分破碎,然后冰上放置10~20min后,再匀浆5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中
4).-20℃冻存。
A-2.组织裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).以下组织的处理应当尽快转移到 4℃无菌器皿中,如结缔组织,脂肪 血管等,最理想的组织应当切成2到3mm的碎块,然后转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).组织碎块在100×g 4℃条件下离心2分钟,小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).转移适当量的细碎切块 (可能冰冻的) 到一个预冷的匀浆器。 (最好是一个玻璃或石英制品),向匀浆器中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取组织块。
7).小心地匀浆组织碎块,可以使用杵磨碎组织细块直到它们成为冰冷的混合体 (例如 牛的肝脏需要10 下) ,尽可能使碎块看不见。需要的用杵磨的次数取决于组织的结构。如果需要提高效率,可以事先使用显微镜观察其结构。目的是为了得到单个细胞,而非对组织进行支离破碎。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在4℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到匀浆器中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
A-3.组织裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).取约1~20mg适量的冻存组织置于EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
B-1.细胞裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).细胞收集好,加入1ml 总蛋白提取液,充分吹打,然后冰上放置10~20minmin后,再吹5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中。
4).-20℃冻存。
B-2.细胞裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).将细胞收集好转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).在100×g 4℃条件下离心2分钟, 小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).向装有洗涤好的细胞的管中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取细胞。
7).小心地吹打细胞,尽可能使细胞看不见。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在 4 ℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液 可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到管中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团.,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
B-3.细胞裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).将细胞收集好在EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
线粒体蛋白提取见附录1
三.蛋白浓度测定:由于采用内参照法校正,省略根据总蛋白浓度估算点样法。
四.SDS-PAGE电泳
1).将抗原(组织/细胞裂解液)样品体积:5×loading buffer体积=5:1,混匀,在100℃加热三分钟以使蛋白质变性。
2).设计加样顺序,作好实验记录,按预定顺序加样。一般每个电泳道加样最大体积为25µl,每个电泳道上样的最低蛋白质量(每一条蛋白质条带):0.1µg(考马斯亮蓝染色)-2ng(银染色),最高蛋白质量(蛋白质混合物):20-40µg。
3).把电泳装置与电源连接好,将电压调至200V,电流应流向阳极,待溴酚蓝迁移到分离胶底部0.5cm处,关闭电源。
4).从电泳装置上卸下凝胶玻璃板,用去离子水冲洗干净。准备进行免疫印操作。
五.免疫印迹操作-转膜
1).将凝胶玻璃板置于盛有电泳转移缓冲液的容器中,浸泡15-20min.。
2).带上手套,裁剪好滤纸(Whatman,3MM CHR)和电转膜,滤纸和膜大小为83mm×75mm,尽量避免污染滤纸和膜,将裁减好的滤纸和膜浸泡与电泳转移缓冲液中,驱除留于膜上的气泡。
3).打开转移盒并放置浅盘中,用转移缓冲液将海绵垫完全浸透后将其放在转移盒壁上,海绵上再放置一张浸湿的Whatman,3MM滤纸。
4).小心将凝胶放置于滤纸上,避免气泡(用转移缓冲液润湿并戴手套以转移缓冲液润湿胶面,小心将电转膜放在胶面上,从凝胶的一边开始轻轻放下可避免气泡,注意一定要戴手套或镊子接触膜)。
5).用去离子水清洗缓冲液槽,在缓冲液槽中放入搅拌子,将另一块海绵用转移缓冲液浸透后放在凝胶-膜“三明治”上,关上转移盒并插入转移槽。
6).将冰盒装入缓冲液槽,注满4℃预冷的转移缓冲液。
7).将整个装置放在磁力搅拌器上并开始搅拌,连接好转移电极恒流300mA转移70min。
8).电转完毕后,将电转膜置于5%的脱脂奶粉(PBS配制)中封闭,37℃2小时或4℃过夜。
六.免疫检测
一抗与靶蛋白的结合
1).封闭的膜用PBST漂洗2-3次。
2).将加样槽洗涤干净,用蒸馏水润洗,晾干,将膜用一次性手套覆盖好,按标记和实验设计切下膜条(一般为3 mm宽左右)按顺序置于加样槽中,作好实验记录,加入相应的一抗约1ml,注意保证膜的所有部分同溶液接触。
3).室温下于摇床孵育2h或4℃过夜。
4).弃去一抗,膜条仍置于加样槽,每个槽加2-3 mlPBST,上摇床洗涤洗涤5-10min ,换液,反复4次。
酶标记二抗与一抗的结合
1).根据实验需要和设计选择合适的酶标二抗和稀释浓度(用含0.5%脱脂奶粉的PBS稀释),每个加样槽中加入二抗1ml左右室温下于摇床孵育1h或4℃过夜,注意保证膜的所有部分同溶液接触。
2).弃去二抗,膜条仍置于加样槽,每个槽加2-3 mlPBST,上摇床洗涤洗涤5-10min ,换液,反复4次。
七.化学发光
将膜风干,贴在玻璃纸上,加底物,做化学发光,得到胶片。将背景较高的底片片放入PIERCE公司X光片背景去除液中,观察到理想的结果时,终止反应,用水清洗以去除不需要的背景。
八.根据实验要求可适当选择Werstern Bolt 膜再生显色法(采用Renewable Buffer膜再生液,ProMab,Cat. No:SJ-200512)
1).在完成WB的显色或化学发光检测后,将蛋白转印膜置1×PBS中漂洗5分钟。
2).弃去1×PBS,加入适量的WB膜再生液,至少需把膜完全覆盖。在摇床上漂洗45min。
3).弃WB膜再生液,加入1×PBS在摇床上漂洗5min后,弃去1×PBS,重复3次洗涤步骤。
4).进行封闭等WB的后续操作。
附录1:
细胞线粒体分离实验步骤
实验试剂:嘉美生物细胞线粒体分离试剂盒 产品编号:P1004
试剂盒组成:
实验步骤:
1).收集约1×106--107细胞(贴壁细胞用PBS洗一遍,胰酶消化后离心,悬浮细胞直接离心);
2).洗涤细胞:用预冷的PBS轻轻重悬细胞沉淀,取少量细胞用于计数,剩余细胞2000rpm,4°C离心5min,弃上清。
3).预处理:加入1-2.5ml临用前添加了PMSF的线粒体分离试剂至细胞中,轻轻悬浮细胞,冰浴放置10—15min。
4).把细胞悬液转移到玻璃匀浆中,匀浆20下左右,把细胞匀浆2000rpm,4°C离心10min。
5).小心把上清转移到另一离心管中,12000rpm,4°C离心10min。
6).小心去除上清,沉淀即为分离得到的细胞线粒体。
7).在分离得到的线粒体样品中加入150—200ul临用前添加了PMSF的线粒体裂解液裂解线粒体,裂解后的线粒体可以用于PAGE、Western、IP及线粒体中的酶活性检测。
1、嘉美生物提供原装进口抗体。
我实验室进行实验服务有若干年的历史,因此我们实验室存有大批的国外原装抗体;意味着实验者不必要花更多的钱去购买国外昂贵(一般都会需要2000元以上)的一抗。
2、嘉美生物免费提供二抗以及所有的与实验相关的后续试剂。
3、嘉美生物免费提供WB标本所需要的蛋白保护液。
该蛋白保护液可以保护样品在4度下保存半个月而不至于蛋白有损失。
4、实验委托者之需要提供样品,即可完成整个实验。
WB实验服务案例
一抗 | 目的蛋白分子量 | 稀释度 | 公司/货号 | 二抗 | 稀释度 |
Goat Rock1 antibody | about 160 kD | 1:500 | SANTA,SC-6055 | Rabbit Anti Goat IgG/HRP | 1:40,000 |
Goat Rock2 antibody | about 160 kD | 1:500 | SANTA,SC-1851 | Rabbit Anti Goat IgG/HRP | 1:40,000 |
Mouse GAPDH antibody | about 37 kD | 1:800 | SANTA,SC-365062 | Goat Anti mouse IgG/HRP | 1:80,000 |
注:SDS-PAGE凝胶浓度为12%;
阳性条带以Gel pro4.0 版凝胶光密度分析软件进行分析,测其IOD(integrated optical density)累积光密度参考值。
Fig 1:
Lanes: | Lane 1 | Lane 2 | Lane 3 | Lane 4 | Lane 5 | Lane 6 |
Rows | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) |
Rock1 | 242.39 | 337.97 | 229.78 | 233.16 | 151.48 | 205.53 |
Rock2 | 233.48 | 219.11 | 238.76 | 191.61 | 151.18 | 203.66 |
GAPDH | 160.18 | 130.47 | 141.06 | 156.13 | 147.77 | 151.07 |
样本编号 | 25 | 38 | 28 | 23 | 26 | 24 |
WB操作规程
一.设备和试剂
1.设备
① 电泳电源
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell,Mini Teans-Blot Module,and PowerPac Basic Power Supply (BIO-RAD,Catalog#165-3323)
② 电泳仪及附件
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell (BIO-RAD,Catalog#165-3301)
③ 电转仪及附件
Mini Teans-Blot Elecreophoresis Transfer Cell (BIO-RAD,Catalog#170- 3930)
④ NC膜
PIERCE,Catalog#88018
⑤ 滤纸
Whatman,3MM CHR
2.试剂
① 凝胶试剂(实验室常备)
试剂名称 | 厂家 |
30%丙烯酰胺溶液 | SIGMA |
Tris-base | SIGMA |
10%SDS | SIGMA |
10%过硫酸铵 | SIGMA |
TEMED | SIGMA |
②Total protein Extraction Kit ,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200501
Renewable Buffer膜再生液,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200512
天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK•德国,Cat. No: 444810
天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK•德国,Cat. No:71183-3
Bradford蛋白浓度测定试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:BRAKIT
细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1001
细胞膜蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1003
③ 常用溶液及缓冲液
A.5%积层胶所用溶液
按总体积2.5ml:
ddH2O:1.7ml
30%丙烯酰胺溶液:0.42ml
1.0mol/L Tris (PH=6.8):0.315ml
10%SDS:25ul
10%过硫酸铵:25ul
TEMED:3ul
B.分离胶溶液配方参考表
C.电泳缓冲液,1L
3g Tris-base、14.4g 甘氨酸、1g SDS,加蒸馏水至IL,pH应该在8.3左右。也可以制成10×的储存液,在室温下长期保存。
D.电泳转移缓冲液,1L
3g Tris-base、14.4g 甘氨酸、甲醇200ml, 加蒸馏水至1L, 也可以制成10×的储存液,在湿温下长期保存。
E.5×样品缓冲液,10ml
0.6ml 1mol/L的Tris-HCl(Ph6.8)、5ml 50%的甘油、2ml 10%的SDS、0.5ml 2-巯基乙醇、1ml 1%溴酚蓝,0.9ml的蒸馏水,可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。
④ 二抗稀释液
用1%BSA-PBS(含0.05%TWEEN20)稀释。
常用Secondary Antibody :
Rabbit Anti Goat IgG/HRP,嘉美生物, SEH0103,(1:10,000~40,000)
Goat Anti Rabbit IgG/HRP (SCBT, Catalog# sc-2030,1:10,000~40,000)
Goat Anti Mouse IgG+A+M(H+L)/HRP, ZYMED, #62-64201(1:40,000~100,000)
Goat anti-rat IgG-HRP,SANTA, sc-2032(1:5 000~1:10 000)
二.蛋白提取(根据样品及检测要求选取以下适当提取方法)
A-1.组织裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).用剪刀剪取约0.5mg组织,置于组织匀浆器中,加入1ml 总蛋白提取液,匀浆5min~20min直到组织充分破碎,然后冰上放置10~20min后,再匀浆5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中
4).-20℃冻存。
A-2.组织裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).以下组织的处理应当尽快转移到 4℃无菌器皿中,如结缔组织,脂肪 血管等,最理想的组织应当切成2到3mm的碎块,然后转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).组织碎块在100×g 4℃条件下离心2分钟,小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).转移适当量的细碎切块 (可能冰冻的) 到一个预冷的匀浆器。 (最好是一个玻璃或石英制品),向匀浆器中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取组织块。
7).小心地匀浆组织碎块,可以使用杵磨碎组织细块直到它们成为冰冷的混合体 (例如 牛的肝脏需要10 下) ,尽可能使碎块看不见。需要的用杵磨的次数取决于组织的结构。如果需要提高效率,可以事先使用显微镜观察其结构。目的是为了得到单个细胞,而非对组织进行支离破碎。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在4℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到匀浆器中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
A-3.组织裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).取约1~20mg适量的冻存组织置于EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
B-1.细胞裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).细胞收集好,加入1ml 总蛋白提取液,充分吹打,然后冰上放置10~20minmin后,再吹5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中。
4).-20℃冻存。
B-2.细胞裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).将细胞收集好转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).在100×g 4℃条件下离心2分钟, 小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).向装有洗涤好的细胞的管中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取细胞。
7).小心地吹打细胞,尽可能使细胞看不见。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在 4 ℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液 可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到管中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团.,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
B-3.细胞裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).将细胞收集好在EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
线粒体蛋白提取见附录1
三.蛋白浓度测定:由于采用内参照法校正,省略根据总蛋白浓度估算点样法。
四.SDS-PAGE电泳
1).将抗原(组织/细胞裂解液)样品体积:5×loading buffer体积=5:1,混匀,在100℃加热三分钟以使蛋白质变性。
2).设计加样顺序,作好实验记录,按预定顺序加样。一般每个电泳道加样最大体积为25µl,每个电泳道上样的最低蛋白质量(每一条蛋白质条带):0.1µg(考马斯亮蓝染色)-2ng(银染色),最高蛋白质量(蛋白质混合物):20-40µg。
3).把电泳装置与电源连接好,将电压调至200V,电流应流向阳极,待溴酚蓝迁移到分离胶底部0.5cm处,关闭电源。
4).从电泳装置上卸下凝胶玻璃板,用去离子水冲洗干净。准备进行免疫印操作。
五.免疫印迹操作-转膜
1).将凝胶玻璃板置于盛有电泳转移缓冲液的容器中,浸泡15-20min.。
2).带上手套,裁剪好滤纸(Whatman,3MM CHR)和电转膜,滤纸和膜大小为83mm×75mm,尽量避免污染滤纸和膜,将裁减好的滤纸和膜浸泡与电泳转移缓冲液中,驱除留于膜上的气泡。
3).打开转移盒并放置浅盘中,用转移缓冲液将海绵垫完全浸透后将其放在转移盒壁上,海绵上再放置一张浸湿的Whatman,3MM滤纸。
4).小心将凝胶放置于滤纸上,避免气泡(用转移缓冲液润湿并戴手套以转移缓冲液润湿胶面,小心将电转膜放在胶面上,从凝胶的一边开始轻轻放下可避免气泡,注意一定要戴手套或镊子接触膜)。
5).用去离子水清洗缓冲液槽,在缓冲液槽中放入搅拌子,将另一块海绵用转移缓冲液浸透后放在凝胶-膜“三明治”上,关上转移盒并插入转移槽。
6).将冰盒装入缓冲液槽,注满4℃预冷的转移缓冲液。
7).将整个装置放在磁力搅拌器上并开始搅拌,连接好转移电极恒流300mA转移70min。
8).电转完毕后,将电转膜置于5%的脱脂奶粉(PBS配制)中封闭,37℃2小时或4℃过夜。
六.免疫检测
一抗与靶蛋白的结合
1).封闭的膜用PBST漂洗2-3次。
2).将加样槽洗涤干净,用蒸馏水润洗,晾干,将膜用一次性手套覆盖好,按标记和实验设计切下膜条(一般为3 mm宽左右)按顺序置于加样槽中,作好实验记录,加入相应的一抗约1ml,注意保证膜的所有部分同溶液接触。
3).室温下于摇床孵育2h或4℃过夜。
4).弃去一抗,膜条仍置于加样槽,每个槽加2-3 mlPBST,上摇床洗涤洗涤5-10min ,换液,反复4次。
酶标记二抗与一抗的结合
1).根据实验需要和设计选择合适的酶标二抗和稀释浓度(用含0.5%脱脂奶粉的PBS稀释),每个加样槽中加入二抗1ml左右室温下于摇床孵育1h或4℃过夜,注意保证膜的所有部分同溶液接触。
2).弃去二抗,膜条仍置于加样槽,每个槽加2-3 mlPBST,上摇床洗涤洗涤5-10min ,换液,反复4次。
七.化学发光
将膜风干,贴在玻璃纸上,加底物,做化学发光,得到胶片。将背景较高的底片片放入PIERCE公司X光片背景去除液中,观察到理想的结果时,终止反应,用水清洗以去除不需要的背景。
八.根据实验要求可适当选择Werstern Bolt 膜再生显色法(采用Renewable Buffer膜再生液,ProMab,Cat. No:SJ-200512)
1).在完成WB的显色或化学发光检测后,将蛋白转印膜置1×PBS中漂洗5分钟。
2).弃去1×PBS,加入适量的WB膜再生液,至少需把膜完全覆盖。在摇床上漂洗45min。
3).弃WB膜再生液,加入1×PBS在摇床上漂洗5min后,弃去1×PBS,重复3次洗涤步骤。
4).进行封闭等WB的后续操作。
附录1:
细胞线粒体分离实验步骤
实验试剂:嘉美生物细胞线粒体分离试剂盒 产品编号:P1004
试剂盒组成:
目录号 | 品名 | 规格 |
P1004-1 | 线粒体分离试剂 | 125ml |
P1004-2 | 台盼蓝染色液 | 10ml |
P1004-3 | 线粒体储存液 | 15ml |
P1004-4 | 线粒体裂解液 | 15ml |
P1004-5 | PMSF(晶体) | 可配制1.5ml 100mM PMSF |
P1004-6 | PMSF(溶剂) | 1.5ml |
实验步骤:
1).收集约1×106--107细胞(贴壁细胞用PBS洗一遍,胰酶消化后离心,悬浮细胞直接离心);
2).洗涤细胞:用预冷的PBS轻轻重悬细胞沉淀,取少量细胞用于计数,剩余细胞2000rpm,4°C离心5min,弃上清。
3).预处理:加入1-2.5ml临用前添加了PMSF的线粒体分离试剂至细胞中,轻轻悬浮细胞,冰浴放置10—15min。
4).把细胞悬液转移到玻璃匀浆中,匀浆20下左右,把细胞匀浆2000rpm,4°C离心10min。
5).小心把上清转移到另一离心管中,12000rpm,4°C离心10min。
6).小心去除上清,沉淀即为分离得到的细胞线粒体。
7).在分离得到的线粒体样品中加入150—200ul临用前添加了PMSF的线粒体裂解液裂解线粒体,裂解后的线粒体可以用于PAGE、Western、IP及线粒体中的酶活性检测。